Broderick a continuat să joace pe Broadway, inclusiv în mai multe musicaluri. A câștigat un al doilea premiu Tony în 1995 pentru interpretarea sa în How to Succeed in Business Without Really Trying și o a treia nominalizare în 2001 pentru The Producers.
În 1985, în timp ce era în vacanță în Irlanda cu fosta sa iubită Jennifer Grey, Broderick a fost implicat într-un accident frontal care a dus la moartea a două persoane locale. A fost considerat vinovat și a fost supus unei pedepse de până la cinci ani de închisoare pentru acuzația de omor din culpă prin conducere periculoasă, dar a fost condamnat pentru o acuzație mai ușoară și amendat cu 100 de lire sterline. Broderick este căsătorit cu actrița Sarah Jessica Parker din 1997, iar cuplul are trei copii.